Tutorial ATHEN

Tutorial for the use of the marking editor ATHEN

Within the context of KALLIMACHOS, an own marking editor was developed for the partial working group [[Novel figures:Main| reader guidance regarding to novel figures. Among the name ATHEN (Annotation and Text Highlighting Environment), a desktop application based on Eclipse RCP 4 and Apache UIMA arose. You can find a comprehensive tutorial as well as an access to the source code and use here.

ATHEN especailly captivates with scalability to novel size as well as adding arbitrary analysis-engines to the program at runtime in this way, wherewhith the actual process of annotation equals to improved suggestions that are automatically generated. ATHEN enables the user to define it's own scheme of annotation in terms of the UIMA- type system and annotate it. As an alternative, the scheme can be created and used in OWL.

ATHEN besitzt neben dem Annotieren von textuellen Dokumenten noch weitere Features:

• OWL-Support zum Erstellen und Annotieren von Ontologien
• Apache Lucene-Support, um effizient Suchanfragen über zuvor erstellte Annotationen (egal ob manuell oder automatisch) zu beantworten.
• Die Erstellung von Figurennetzwerken
• Das Annotieren von Bilddaten durch spezielle Annotationen in Apache UIMA
• Die Möglichkeit Annotationen (etwa mehrerer Annotatoren) gegenüber zu stellen, mit automatischer Anzeige der Übereinstimmung.
• Eine vollständige Unterstützung des Prozessmodells medizinischer, ontologiebasierter Informationsextraktion.
• Konfigurierbare, automatische Vorverarbeitung und Anwendung UIMA basierter Analysis Engines
• Das Konvertieren zwischen verschiedenen Formaten
• Eine Erweiterbarkeit, ohne den eigentlichen Code verändern zu müssen durch sein flexibles OSGI-Design
• Eine selbst konfigurierbare Oberfläche durch das Einstellen der sichtbaren Views.

Darüber hinaus unterstützt ATHEN in besonderer Weise das Annotieren folgender Vorhaben:

• Named Entities
• Koreferenzen
• Relationen
• Direkte Reden inklusive Sprecher und Angesprochener Entität
• Szenen
• Konstituenzgrammatiken
• Dependenzgrammatiken